Vernis puis joint ou joint puis vernis?...

Bonsoir,
Je refais actuellement tous les vernis de mon bateau. Le plat bord en bois (teck) est constitué de plusieurs pièces de bois. Elles sont fixées et entre elles il y a (avait car il est mort) du joint SIKA (ou équivalent) comme sur un pont. J'ai poncé tous le bois et retirer les anciens joints (ce qu'il en restait). Dois-je vernir puis après refaire les joints ou d'abord refaire les joints et vernir ensuite? Je serai tenté par la première solution. Quel est votre avis?
Merci.